他像一隻風箏，飛得再高線也是牽在別人手裏。民國七年（1918）夏，尹昌衡從南京又到了北京。
這時，果如馮國璋一年前說的那樣，他這個代總統期滿後，按時“榮歸”，而段祺瑞控製的國會選出了徐世昌為新一屆民國大總統。徐世昌，字東海，天津人，時年63歲，清光緒進士，曾受清翰林院編修，曾經在清廷擔任過許多要職。是他幫助袁世凱創辦了北洋係，1914年，在袁世凱當政時，他作過袁的國務卿。他的經曆與趙爾巽很是相同，是袁世凱的“嵩山四友”之一。
尹昌衡最初在南京得知中央要樞人事變化的消息後，立即去找江蘇督軍李純，說是“馮公當初答應過我，他的代總統期滿後，就讓我回四川，我現在來辭行。”李純笑笑：“和尚走了，廟還在。馮公雖然已經榮歸，但徐海東已經繼任，你的事歸他管，你回不回四川，還得請示。”結果是，北京方麵送來三紙聘書，聘尹昌衡為總統府顧問、國務院顧問、陸軍部顧問，並附徐大總統令：“請尹昌衡顧問即日進京。有關西藏問題，本大總統要向他垂詢……”
北京，還是那副以不變對萬變的老樣子。暮藹時分，殘雲緩緩地在天空門上空浮動，斑駁的紅牆，金碧輝煌的宮殿……然而，他從一路上遊行示威的學生與市民隊伍身上，剛到北京的尹昌衡聽到了於無聲處的驚雷。
剛剛安下身來，尹昌衡就三番五次去總統府，請求徐大總統“垂詢”，可是，連人都沒有見著，有關方麵回話：“稍安勿躁！”
看來，四川是一時回不去了，他和殷，原二位太太，還有副官馬忠不能久住在招待所室裏，他隻好買了一院房子，作長住的準備。房子在國祥胡同，中式院落，足有一畝。徐大總統雖然沒有見他，卻關注著他，送給他一座花園，派人送來地契，就在他住的對麵。這花園原是清廷一位王爺王府的一角，約有五畝。花園裏有亭台樓閣，魚池假山，倒是個休閑好去處。這樣一來，有住的房子，對麵又有一座屬於自己的私家花園，像個居家過日子的樣子了。也好，他就去信，請在成都老家的父母妻兒一並來京闔家團圓。成都老家的人商議後，老太太堅持不走，留下看家，照料產業。老太爺尹仕忠率兒媳顏機，姨太太楊倩並長子宣桓不顧山高水長路遠，去了北京，同分別了六年的尹昌衡團聚了。