自身免疫性疾病（Autoimmune Diseases，AID）是指機體產生高滴度自身抗體和（或）自身反應性淋巴細胞攻擊相應的自身正常細胞和組織，導致組織器官損傷和功能障礙的一組疾病。常見的妊娠合並AID有：抗磷脂綜合征（Antiphospholipid Syndrome， APS）、係統性紅斑狼瘡（Systemic Lupus Erythematosus，SLE）、未分化結締組織病（Undifferentiated Connective Tissue Disease， UCTD）、幹燥綜合征（Sjogren Syndrome，SS）、類風濕性關節炎（Rheumatoid Arthritis，RA）等。
妊娠合並AID患者由於免疫複合物廣泛沉積於血管內皮，導致內皮損傷，血小板活化聚集及白細胞、紅細胞黏附於受損的血管內皮，可誘發動、靜脈血栓形成，從而增加流產、早產、胎兒生長受限、羊水過少、死胎、子癇前症/子癇、溶血—肝酶升高—血小板減少綜合征等不良妊娠結局的發病風險，嚴重者可危及母胎生命。
AID患者孕期需要婦產科、生殖科、風濕免疫科醫師多學科共同管理，AID患者孕期對於低劑量阿司匹林、低分子肝素的使用參見相應章節，本章節重點討論免疫抑製劑的使用。
一、妊娠期免疫抑製劑的選用
（一）妊娠期可以安全使用的免疫抑製劑：包括小劑量不含氟的糖皮質激素、羥氯喹（Hydroxychloroquine，HCQ）、柳氮磺吡啶（Sulfasalazine，SSZ）、硫唑嘌呤（Azathioprine，AZA）、他克莫司（Tacrolimus，FK506）、環孢素（Cyclosporin A，CsA）等。
（二）環磷酰胺（Cyclophosphamide，CYC）：CYC在妊娠早期使用有致畸性和致流產性，隻有在妊娠中、晚期病情嚴重，而其他免疫抑製劑無法控製的風濕免疫病患者中，為挽救患者的生命時才考慮使用。但臨床醫師仍需謹慎使用CYC，同時考慮終止妊娠。
（三）生物製劑：目前有限的觀察性研究結果表明，腫瘤壞死因子抑製劑（Anti-tumor Necrosis Factor inhibitors）雖可通過母-胎屏障，但在妊娠期使用未觀察到明顯的致畸事件。其中英夫利昔單抗（Infliximab）、阿達木單抗（Adalimumab）可在胎兒體內聚集，而賽妥珠單抗（Certolizumab）、依那西普（Etanercept）穿透胎盤能力較弱。因體內留存的藥物作用，為避免使用疫苗繼發感染，國外指南建議應用過此類生物製劑的嬰兒在出生後6個月內禁止接種減毒活疫苗。此外，根據臨床試驗、誌願者報告及上市後監測的數據，CD20單抗（利妥昔單抗，Rituximab）雖不增加畸形率，但會增加流產率，也可能與較為嚴重的風濕免疫病有關；貝利單抗（Belimumab）伴隨藥物聯用因素，可能增加流產率及畸形率；托珠單抗（Tocilizumab）與氨甲蝶呤（Methotrexate，MTX）聯用，可增加流產率，畸形率未見增加；阿巴西普（Abatacept）與MTX聯用，可增加流產率及畸形率。烏司奴單抗（Ustekinumab）、阿那白滯素（Anakinra）不增加流產率及畸形率，但樣本量小，且缺乏對照研究資料。