四、二代測序檢測報告解讀
目前，二代測序檢測報告建議以ACMG指南為標準，檢測結果中需列出具體的變異位點信息，包括基因名稱、所參考的人類基因組版本號、基因或轉錄本參考序列（NM_編號）和版本號、核苷酸變異、氨基酸變異、外顯子/內含子序號、等位基因雜合性、染色體編號和坐標、變異的親源等，提供對該變異致病性的判斷及支持該判斷的依據和文獻。其中變異位點的命名可按照人類基因組變異協會（Human Genome Variation Society，HGVS）的規定；轉錄本的選擇建議采用基因座參考基因組序列數據庫（Locus Reference Genomic，https：//www.lrg-sequence.org/）界定的轉錄本或多個國際數據庫公認的主要轉錄本；對於變異位點致病性的評級建議根據ACMG的指南分為致病、疑似致病、臨床意義未明、疑似良性、良性5個等級。指南提供了28個標準，每個標準對應了一個代碼（如PVS1、BA1）代表不同類型的證據，每個標準的代碼由致病性和強度兩部分組成，致病性又分為良性（B）及致病（P），證據強度由強到弱依次分為單獨證據（A）、非常強（VS）、強（S）、中等（M）、支持（P），除此之外，指南提供了相應的組合規則對突變位點進行判定。
當前臨床進行產前WES或WGS的主要挑戰之一，是這些檢測的潛在檢測周期長。盡管通過孕早期掃描測量NT和唐氏綜合征篩查，在妊娠早期發現嚴重或致死的先天性疾病的頻率越來越高，但大多數胎兒結構異常需要在孕18~22周的孕中期超聲掃描中才能被發現。這意味著必須快速完成基因檢測，以便在懷孕期間為決策提供信息，這就要求DNA測序和數據注釋分析的環節必須快速準確。使用針對特定胎兒異常的基因panel的分析流程也可以縮短分析周期，要實現這一點，必須具有特定和明確的表型，這在產前尤其具有挑戰性。因此，實際上WES可能是目前實現快速診斷的最有效手段。隨著對變異的理解不斷加深，WES可能有助於告知未來目標基因panel的信息，對我們進行WES注釋與分析的水平提出了更高的要求。