在董鄂妃死後，順治難以接受眼前的現實，也無力承受這巨大的精神刺激，已萬念俱灰。他覺得“財寶妻孥，人生最貪戀擺撥不下。朕於財寶固然不在意中，即妻孥亦覺風雲聚散，沒甚關係。若非皇太後一人一念，便可隨老和尚出家去”。其間，他曾要求茆溪行森禪師為他剪掉發辮，以削發為僧，遁入空門。似乎隻有如此，才能真正解脫內心的痛苦。但在孝莊皇太後及群臣的奮力阻止下，他的打算未能成功，也就未解脫內心的痛楚、煩悶和思念之情。在這種欲罷不能的情況下，順治讓他最寵信的太監吳良輔做自己的替身，去北京廣安門外憫忠寺（法源寺）削發為僧，以還自己的心願。
太監吳良輔按照主子的旨意，削發為僧，真的在憫忠寺念起佛來。順治內心稍感寬慰，並於十八年正月初二親自到憫忠寺觀看吳良輔做和尚後的情形。就在這次察看中，順治對寺院和僧侶生活產生了一種比先前更加熾烈的感情。他用手輕輕拂著香案，對住持僧說：“我覺得這裏的一切都極其熟悉和難以割舍，我好像看到我的前世就是一位僧人。”由於這種近似癡情的愛戀，順治出家的欲望達到了極點。要不是孝莊皇太後派人前來督促他回宮，他一定會留宿於寺院。如果不是他在幾日之後便赴黃泉，或許他真的就做了出家的和尚。但曆史沒有成全他，他還是在皇太後的壓力下，懷著無限的悲愁回到了那早已厭倦的皇宮。想不到，這次回去，就再也沒有機會善結佛緣，而隻留下一個美麗的傳說了。就在他回宮的第二天，便因出痘而“聖躬少安”，第三天就已“聖躬不安之甚”，第四天，即正月初五日丙辰，順治宣原任學士麻勒吉、學士王熙至養心殿，降旨一一自責，定皇上禦名，命立皇太子，並諭命索尼、蘇克薩哈、遏必隆、鼇拜為輔政四大臣，令草遺詔。初六日，三鼓時分，順治感到生命垂危，大限迫近，急命太監傳諭王熙、麻勒吉入養心殿撰擬遺詔。順治斜躺在病榻上，對二人宣諭：“朕患痘，勢將不起，你可詳聽朕言，速撰詔書。”二人聞諭，即在病榻前開始“恭聆天語”，並“五內崩摧，淚不轉止，奏對不成語”。順治以極為親切友善的口氣說道：“朕平日待爾如何優渥，訓爾如何詳切，今事已至此，皆有定數。君臣遇合，緣盡則離，爾不必如此悲痛。此何時，尚可遷延從事，致誤大事……”王熙、麻勒吉將連夜起草的遺詔送皇帝過目，修改了三遍，直至第二天清晨才最後定稿。又過了一個白天，到初七日子夜時分，身患天花的大清順治皇帝駕崩於養心殿，時年二十四歲。