1125年，金滅遼。1127年，繼滅宋。
1128年，金左副元帥宗翰命部將婁室攻下陝西同、華、京兆、鳳翔等地，在一番搶掠燒殺之後，還軍山西。同年九月，金太宗又命婁室攻取華州、下邦、蒲城、同州，十一月攻下延安府。次年二月，麟、府、豐三州降金，四月又占鄜、坊二州。再次年，耀州、鳳翔府、渭州、原州亦相繼降金。至1131年，東起淮水，西至秦嶺，形成了宋、金間的一條非經雙方議定的臨時界線。這條界線的形成，標誌著陝西秦嶺以北地區已被金所實際統治的事實。位於這個地區的法門寺，也自然地置於金的統治之下。
金朝共曆八帝110年，至第四帝世宗朝達到頂點，至金章宗以後開始衰落。金代各帝大多崇信和支持佛法，太宗、熙宗都有建寺、設齋等大的法事活動，世宗則大興土木建寺立廟，賜予寺院大量土地、金錢，並允許寺院賣牒聚財。同時又對此做出一定的限製，例如禁止民間建寺，整頓僧人隊伍，以防止其逃避賦役等。到章宗一朝，則進一步規定不得私度僧尼，行試經度僧製，甚至規定不同地位的僧人所帶徒的不同數目，和僧人通過課試經律論獲取尊號的命令。這種既推崇又限製的政策，使金代前半期的佛教在一定程度上避免了偽、濫的問題，禪、淨、華嚴、密、律各宗都各有發展。自金章宗末年開始，賣牒取費以解國家財政拮據的方法被大肆使用，終於引導金代佛教在陷於泛濫的同時也走上了末路。
就這個時期的法門寺而言，基本保持了平穩的過渡時期，沒有遭受大的洗劫和毀壞，亦未有發展壯大之勢，從現存的資料來看，有兩塊碑文倒是值得觀賞品評一番。
其一是大安二年（1210年）所刻《謹賦律詩九韻奉讚法門寺真身寶塔碑》，碑文曰：
寺名曾富布金田，塔字來從梵夾傳。