對曾國荃而言，1862年流年不利。前半年很利，他摧枯拉朽就奔到了天京城下。在過度興奮的最初幾天裏，他在雨花台幾乎能聽到洪秀全的唉聲歎氣，甚至能觸摸到洪秀全那一夜之間仿佛蒼老了一百歲的令人作嘔的老人斑。
但下半年就大大不利了。先是各路兵團無法抵達，然後就是天大的麻煩——瘟疫。老子說過，“大軍之後，必有凶年”。其實，戰爭進行時就是凶年，殺掉的人沒有時間掩埋，病菌滋生，瘟疫就無可避免。1862年7月末，曾國荃軍中就已有瘟疫，因為他始終關注著天京動向，所以沒放在心上。僅一個月後，瘟疫開始在軍中流行，他的一半士兵都染上疾病，高燒不退，上吐下瀉，吃什麽靈丹妙藥都無法緩解。
曾國荃急了，給老哥去信，請求醫療隊支援。曾國藩回信，神情沮喪地說：“不是你的軍隊裏有瘟疫，各支湘軍隊伍中都發生了，連遠在浙江的左宗棠部隊也有了，我能為你做的隻能為你源源不斷輸送藥草，不過現在這段時間，藥草奇缺，你好自為之。”
曾國荃大為失望，也緊張起來。他現在是孤軍深入，前後左右都是敵人，倘若此時敵人向他發動進攻，那他非死無葬身之地不可。如果他當時在天京政府裏有臥底，就知道自己的擔心純屬多餘。
洪秀全的確在等待援軍，可援軍短時間內不會到來。自曾國荃把軍隊駐紮於雨花台後，洪秀全的內心片刻未曾寧靜過。他一麵下令嚴防死守，一麵催促遠在上海的李秀成回援天京。
李秀成正在和李鴻章的淮軍苦戰，處境雖談不上艱難，卻也不順利。得到洪秀全的求救信後，他並不覺得這是很嚴重的事。十年來，天京曾多次被圍，最多一次多達七萬人圍困天京，可最終還是輕描淡寫地解圍。李秀成認為，天京城高池深，曾國荃人太少，不可能短時間內攻破。隻要自己保證天京的糧草彈藥供應，天京對曾國荃而言就是禁地。