路德雖然反對激進派運動、騎士暴動和普通人革命，但卻沒有放棄宗教改革主張。即使在普通人革命如火如荼地進行期間，他也繼續按照其原則進行宗教改革。然而，路德也認識到，宗教改革家的力量是有限的，要開展更大規模的改革，必須依靠當局的支持。而隨著宗教改革的深入進行，組建福音教會越來越成為迫切之事了。
對於福音教會的性質、組織原則、禮拜儀式、教牧製度等等，路德也早有思考和論述。首先是否定羅馬教皇對於教會的統治，要求樹立基督的權威。路德指出，真正的教會是“世上一切基督信徒的集會”，是無形的，它“包括那些生活在真正信、望、愛裏麵的人，……是一個在同一信仰裏屬靈的集會”，其首領也是屬靈的。隻有在天上的基督才能統治這個屬靈的世界。然而，在現實生活中，基督徒不能不有教堂，也要隆重舉行對上帝的禮拜，隻是這一切須有一個限度。禮拜的設備隻宜尚清潔，不宜尚華貴。路德也剝掉了教士等級的神聖外衣，強**士職業的服務性質，認為被授予聖職者不是高於君主、貴族、農民、工匠等一般教徒的特權等級，執行“聖禮”的教會神職人員也不擁有為信徒赦罪的能力。他們隻是教會的“仆人”“執事”“管家”，應由全體信徒選舉產生並受後者的監督。信徒享有選舉和罷免自己的牧師的權力。任何人未經全體教徒同意和選舉，不得執行屬於大家權力範圍以內的事。
福音教會外在的最主要標誌是有上帝的話；上帝的話記錄在《聖經》之中，由教士傳講於世，由教徒虔誠的信服，公開在世人麵前承認。“上帝的道是在一切之先，有道然後有信，有信然後有愛，有愛行出的善事，因愛是不加害於人的，所以愛就完全有了律法。”屬基督的聖民是由他們有上帝的道而識別，“何處以上帝的話純正教導人，何處就有正直真正的教會”。路德並沒有發明講道，但他把講道提升到了基督教崇拜的一個新高度。講道的中心必須是耶穌基督，講道的主要目的是使人以信接受基督。忠實的講道人應該隻講上帝的道，並隻尋求他的榮耀和讚美。同樣，聽眾也應該隻相信救世主基督而不是牧師。講道人必須精通聖經，不應該使用艱深的神學詞匯，而應該使用普通大眾那種清晰又幹脆的語言。最重要的是，講道必須忠於其適當的內容，即基督。隻有這樣，講道才能成為所有聖禮中的主要部分。