萬曆三十八年（1610）十二月二十四日，又一位男孩降生於東宮之內。按照“由字輩、木字旁”的玉牒規定，東宮的這位第五子取名由檢。
由檢的父親常洛當時仍是太子身份。這位萬曆帝的長子，自從生下來便遭白眼，很不得寵，淒淒慘慘過到萬曆二十九年（1601），才被正式冊封為太子，當時他已是二十歲了。到萬曆三十三年（1605）十一月，順天府籍的選侍王氏為東宮生下了長子由校。爾後，這位太子的選侍、才人們又先後生下幾子，到由檢降生時已是第五子了。當時的太子常洛，在宮中的生活十分壓抑，除了生兒育女，保證血脈興旺外，似乎也無別的辦法來向他的父親萬曆帝證明他的才能。由檢的降臨，對他似乎也無特別的意義，並不像長子由校出生時那麽顯得重要。
既然已被冊封為太子，那麽朱常洛就有權利擁有眾多選侍、才人之類的女性。在這一點上，沒有人能夠阻止。朱由檢的生母就是屬於上述女性中的一位。
這位女性姓劉，當時的身份是選侍。她也是被選人宮的淑女，娘家的身份很一般。按照當時宮中的規矩，劉選侍既為太子生了一位男孩，本應母以子貴，過上舒心些的生活。不幸的是，太子身邊有康妃（西李）之類的人爭寵邀幸。她們的如簧之舌沒有停止過說三道四。太子便漸漸疏遠了劉選侍，到後來甚至動輒尋隙斥責。可憐的劉選侍，並沒有得到應該有的待遇。
據說劉選侍為人忠厚賢惠，恪守婦道。她對自己所受的不公待遇，毫不辯解，隻是將萬般委屈和激憤深藏於心。久而久之，自然是積鬱成疾。就在由檢五歲多時，這位劉選侍終於鬱鬱而死，被太子常洛草草葬在西山。
由檢年幼喪母，自然思念不已，但又不敢聲張。他當時住在勖勤宮，曾悄悄向近侍詢問：