首輔李國在此年五月致仕。他是魏忠賢的同鄉，能入閣多少沾了點魏忠賢的光，別人一般也是這樣想的。但李國做事，尚有分寸，每持正論。他繼黃立極出任首輔五個月，日子極為難過。朝廷對魏忠賢集團的清算愈演愈烈，而他卻是天啟舊臣，靠魏忠賢提攜才人了閣，因此有些話也說不出口。到五月初，他見事已不可為，便上疏乞歸，返鄉不久後就去世。臨去職前，他推薦了韓鑛、孫承宗這兩位帶有東林色彩的大臣代替他。
李國去職後，來宗道出任內閣首輔。這位來宗道與魏忠賢的關係也說不清楚。他做事詭秘，為人圓滑。在魏忠賢時代，他與另一位內閣大學士楊景辰出任過《三朝要典》的副總裁，而到崇禎帝要毀該書時，他也舉雙手讚成。他對東林一案的平反，態度不是很積極。他曾笑著對倪元璐說：
“你這人也真是多事！按照成例，像你這樣的翰林編修，隻是香茗一杯而已。”
意思是怪倪元璐為東林出頭，是過於多事。因此當時朝野給了來宗道一個“雅號”，稱他是“清客宰相”。當時朝廷的氣氛，自然容他不得。東林派的官員，紛紛上疏彈劾。來宗道便與楊景辰一起，在六月被罷免。
也就是在這個月，魏忠賢原先的兩位幹將魏秉謙、馮銓被削籍。這兩位幹將在魏忠賢擅權時，便因內部矛盾，卸職不幹，至此也被處罰。另一位幹將許顯純也在此時被斬首。據說在會審許顯純時，後來成為大思想家的黃宗羲，乘隙上去用鐵錐狠狠地刺了一錐，算是為自己慘死在許顯純手裏的父親黃尊素報了一錐之仇。
來宗道下台後，劉鴻訓實際上就是內閣的當權派。這位劉鴻訓做事剛正果斷。他利用當時朝廷的局勢，毅然罷斥楊維垣、李恒茂、楊所修、孫之獬、阮大铖等人，據說是人心大快，但也引起了對手的仇恨。到了十月份，劉鴻訓竟被趕下了台，落得個充軍戍邊的慘局。