在敘述張獻忠穀城受撫之前，有必要追述一下朝廷方麵的有關情況。
崇禎七年（1634）正月，因農民軍勢力越來越大，範圍越來越廣，朝廷特進延綏總督陳奇瑜為兵部右侍郎，總督陝西、山西、河南、湖廣、四川諸省軍務，以重臣開督府，統攝討伐之事。沒想到陳奇瑜這位書呆子，在漢中上了張獻忠等的詐降之當，失去了全殲農民軍主力的絕好機會。崇禎帝大怒之下，查辦了陳奇瑜，並重用了洪承疇。
十二月，洪承疇被任命為兵部尚書，兼督晉、陝、豫、川、楚諸省軍務。洪承疇依靠鎮壓農民軍，由一位小小的道員接連破格升遷，至此而極。崇禎帝全力支持洪承疇，並令他於六個月內必須徹底解決問題。
沒想到農民軍竟於崇禎八年（1635）正月由河南奇襲鳳陽，一舉得手，令天下大震。至同年八月，崇禎帝見洪承疇一人難當重任，便又任命湖廣巡撫盧象升升任兵部右侍郎兼右僉都禦史，總理直隸、河南、山東、四川、湖廣五省軍務，並規定盧象升負責東南，洪承疇負責西北，聯手合剿。
盧象升接手東南戰事後，敢打敢拚，竭盡全力，其局麵雖不能說占盡優勢，卻至少尚能維持。到崇禎九年（1636）春夏，正當盧象升與洪承疇對農民軍展開東西夾擊，形勢極為有利時，朝廷卻因清兵入侵，不斷抽調中原戰場上的邊兵精銳入衛北京。到九月份，崇禎帝竟下令當時正在鄖西追殺農民軍的盧象升，總督各鎮兵馬對抗清軍。不久，盧象升又被任命為總督，主持宣大、山西軍務，正式離開了中原前線。
盧象升的調離，是朝廷的重大損失，直接導致了中原戰場的惡化。這一重大人事變動，雖說是首輔溫體仁暗中操縱，但崇禎帝也難辭其咎。
接替盧象升的是王家楨。
王家楨，直隸長垣人，天啟年間進士，素喜談兵，官至兵部侍郎。至此，因盧象升調赴邊關，王家楨才又被召複出，總督五省軍務，不久又兼河南巡撫。此人少有將才，既無才能，又無魄力，上任後除在河南南陽進剿當地農民軍首領楊四處外，竟然舉兵不知所進，更不敢出中州半步。他認為自己的處境比盧象升更難，注定難有起色，於是從一上任開始，便以身體有病為由連上辭呈。崇禎帝先是準他辭去總督之職，專任河南巡撫。不久，他的家兵竟發生了嘩變。一方大將，竟連自己的家兵也約束不住，哪裏還談得上剿匪滅賊！崇禎帝一氣之下，將他革職。