正月裏，關東聯軍還是同西北軍交鋒了。
由河內太守王匡率領的關東聯軍先頭部隊，到達洛陽東北的河陽津渡口，打算渡黃河南進。董卓派出兩支人馬迎敵。一支向平陰渡進發，做出從這裏渡河進擊的態勢；另一支則悄悄地從小平津渡河，向北行進了一段，再向東繞至敵後。王匡的人馬遭受慘敗，幾乎全軍覆沒。關東聯軍銳氣大挫。
很快，董卓作出了一個具有長久戰略意義的選擇，遷都長安。
進軍京師的期間，董卓明白了一個道理，大漢確實如袁本初所言：恩澤深厚，兆民戴之。今天下大亂，但大漢天子這個名稱，可以成為一切舉措的最正當的借口。京師是大漢二百多年的首都，這裏根基牢固，難以動搖，要控製天子，進而自己稱帝，必須把天子挾持到自己的根據地——關西。
他準備迅速行動，先將天子遷出京師，自己率部分西北軍擊垮關東聯軍。這一方麵是考慮到關東聯軍的威脅；另一方麵，董卓得到了一個情報：南匈奴單於於扶羅率數千騎兵與河北諸山穀黃巾的一支——郭太所率白波穀黃巾合兵一處，寇掠郡縣，兵馬已至河東平陽。如果他們渡過黃河，從東京洛陽去西京長安的通道將被切斷。
董卓在正式召集公卿商議遷都之前，上表奏請拜河南尹朱俊為太仆。作為自己的副手，他對朱俊在軍事上的才幹十分欣賞。先帝駕崩之際，河北諸山穀的黃巾曾經寇掠河內，逼進京師，朱俊就任河內太守，帶著家兵將黃巾擊退。董卓想讓他謀劃洛陽一帶的軍事。可朱俊將軍對董相國派來的使者說：“國家西遷，必負天下之望，以成山東之釁，臣不知其可也。”
使者說：“相國召君受拜而君拒之，沒有問君遷都之事而君卻言之，這是何故？”
“做相國之副，非臣所能勝任；遷都不是個好辦法，這是國事之所急。臣辭所不堪，言其所急，正是做臣子應該做的。”