相對於如今諸多大學畢業生，從事的工作跟自己的專業沒有半點關係的尷尬境遇而言，馬化騰算是“門當戶對”地做起了自己的事業。當然，這也與馬化騰在學校四年裏的刻苦攻讀有著密不可分的聯係。
1993年，作為深圳大學的優秀畢業生之一，馬化騰並沒有選擇離開深圳，而是跟當時很多人一樣，決定繼續留在機遇寶地深圳闖一闖。
20世紀90年代初期，尋呼機是紅遍中國的一種通信工具。馬化騰的第一份工作就是在經營尋呼業務的潤迅公司做的。這家公司在20世紀90年代的中國頗有名氣，是當時深圳乃至中國通信產業的一顆明珠，其“一呼天下應”的廣告至今仍讓很多人印象深刻。當時的尋呼業務在中國算是高新技術業務，從事這一行的企業一般都有相關背景。由於相對壟斷，中國最早的這批尋呼企業過的簡直就是天堂般的日子。
馬化騰憑借著優秀的技能，很快成了潤迅公司的軟件工程師，負責尋呼軟件的開發。由於適應能力快，加上努力學習，馬化騰很快就從普通員工做到了潤迅公司的開發部主管。這段經曆使馬化騰明確了開發軟件的意義就在於實用，而不是開發者的自娛自樂。在潤訊工作期間，馬化騰的視野變得開闊了，並且這一工作經曆給馬化騰日後的管理工作帶來了必要的啟蒙。
然而，學計算機技術的馬化騰始終拋不下對互聯網的熱情，而且馬化騰堅信，如果能將互聯網與當時的無線尋呼業務結合，必然能大大改善尋呼機的用途。馬化騰做了一個係統模型，並向公司做了重點推薦。但很可惜，公司並沒有采納馬化騰的意見。
堅信互聯網未來的馬化騰此時萌生了辭職創業的想法。然而，創業是需要錢的，錢從哪裏來，成了困擾馬化騰的最大難題。1994年，馬化騰隨大溜進入了股市，希望能通過炒股獲得創業的第一桶金。選擇炒股完全是受大環境的影響，當時的深圳，炒股已然成了一項全民運動。據馬化騰的回憶，那個時候的股市，隻要進去了就有錢撿：“有一家公司的樓下就是營業廳，在營業廳看盤的時候還是五塊錢一股，跑上樓找人買股票時，已經漲到了六塊錢，下樓時就變成了七塊錢。一個上午賬麵就多了幾十萬，吃飯都不知道什麽味道。”