正德十四年寧王宸濠反，朱厚照自己親征，命永率邊兵兩千人先行，時王守仁已將宸濠擒獲，他便從王守仁手中將宸濠奪取，歸功自己。朱厚照死，他曾提督九門防變。朱厚熜即位，連遭降斥，但不久仍起用提督團營，未幾死。這是朱厚照時一員最著名的宦官特務大將。
穀大用在劉瑾時曾提督西廠，瑾死辭職。正德六年，劉六、劉七反，兵部侍郎陸完屢以邊兵獲勝，大用和張忠心想劉六等可以即平，便計劃督軍以出，希望像張永之於寧夏。於是朱厚照便命他總督軍務，伏羌伯毛銳充總兵官，太監張忠監管神槍，統領京營官軍五千人，會侍郎陸完前往鎮壓。時陸完以部堂為文帥，僅得提督，還要聽大用的指揮。大用兵發，駐紮臨清，又召邊將許恭、卻永、江彬、劉暉等入內地聽調遣。久之召還。大用自慚無功，便奏稱：“副總兵許泰、劉暉、馮楨、時源，參將金輔、神周，遊擊將軍卻永等屢有斬獲功，都禦史陸完，嫻於戎務，侍郎楊潭督餉不乏，請亟施大賚。”又言軍中勞苦及賑恤數事。這一方麵是掩飾自己的無功，另一方麵便是想邀爵賞。果然，朱厚照便下旨說：“大用統帥軍旅，多效勤勞，兵部會官議以聞。”廷議結果，覺得無功封爵實在說不過去，但又不敢違抗大用的意思，隻得委婉地誇讚了一番，說是：
四方盜賊蜂起，自出師以來，所向克捷。諸將親冒矢石，其功居多，而督軍督餉者亦與有力，升賞宜厚。但始者奏定格例，為殲滅山東、河南一夥賊盡絕者，乃如寧夏例論功封拜，今賊首未擒，難以卒議，且泰、楨、永、源、周及完近已加升，宜通候功成之日，奏請定奪，若軍士首功，勘籍已至者，即請如例升賞，其未至者，令紀功官以次勘報。(115)
議上，大用特賜敕獎勵。這以後他仍是不斷地管理軍務，如正德十二年八月，朱厚照便服出居庸關，不願廷臣追諫阻止，便叫大用守關，不準放出一人。(116)朱厚熜即位，大用降守康陵。