東晉左仆射、後將軍、丹陽尹王國寶和建威將軍王緒攀附著司馬道子，狐假虎威，大肆收受賄賂，為人奢侈，吃穿用度直逼皇宮中的待遇。王恭和殷仲堪的存在對他們是個威脅，他們總感覺如芒在背，因此多次勸司馬道子罷免此二人的兵權。
王恭派人去荊州見殷仲堪，商量怎麽對付王國寶等人。南郡公桓玄不得誌，想趁火打劫，就極力勸殷仲堪道：“王國寶和你們是死對頭，現在他手握重權，王恭是皇上的親舅舅，王國寶肯定不敢加害他，到時候您就首當其衝了！如果他讓皇上召你回朝做尚書令，罷了您的兵權，命殷覬任荊州刺史，您該怎麽辦？”
殷仲堪皺著眉頭問道：“我也苦惱一段時間了，你說該怎麽辦？”
桓玄接著道：“您應該和王恭一同起兵清君側，這才是上策。”
殷仲堪於是和堂兄南蠻校尉殷覬、南郡太守江績等人在一起謀劃，殷覬表示反對，他說道：“我們應該堅守本職，朝廷的是非不該我們過問，我反對出兵。”殷仲堪一再堅持，殷覬生氣了，但也沒辦法，隻好說道：“我不讚成，也不反對。”之後便假稱有病，辭職回家了。
江績也表示反對，殷仲堪讓楊佺期代替江績為南郡太守，朝廷召江績回朝任禦史中丞。殷仲堪又和雍州刺史郗恢商量，郗恢也不同意。這麽多人都持反對意見，殷仲堪也犯了猶豫，恰巧王恭的使者來到，殷仲堪的膽又壯起來了。
王恭上書朝廷，列舉王國寶的種種惡行，拉起清君側的大旗起兵。司馬道子收到奏章後驚慌失措，心想隻能舍車保帥了，於是把罪過統統推到王國寶一個人身上，派人把王國寶抓住，交付廷尉治罪。
隆安元年（397）四月十七日，朝廷下詔，命王國寶自盡，並把王緒綁赴街市問斬。司馬道子還派人向王恭道歉，王恭也不好繼續深究，便率軍撤回了京口。