因為東學黨已經撤離全州，朝鮮官員已回任，各國都認為叛亂已經平定，中日兩國都應當撤回軍隊。中國沒有問題，袁世凱已經與大鳥圭介商定同時撤軍，但日本並不想撤兵，因此又找了一個新借口，提出與中國共同改革朝鮮內政的計劃。
這個計劃完全由伊藤博文起草，主要三項內容：一是中日軍隊共同平定朝鮮內亂；二是中日共同派員改革朝鮮內政；三是整頓朝鮮財政。陸奧宗光看罷後道：“好極了，有了這個方案，我國在外交上也將占據主動。中國一直以朝鮮的宗主國自居，肯定不會答應我們的提議。即便中國不答應，我們也不能將此提案投入廢紙簍中。所以，我建議應當加上兩條，以明確我們的外交方略。”
伊藤博文問道：“噢，是哪兩條，不妨直言。”
陸奧宗光回道：“一是不問與中國政府的商議能否成功，在獲得結果以前，我國決不撤回目下在朝鮮的軍隊；二是若中國政府不讚同日本提案時，帝國政府當獨力使朝鮮政府實現上述之改革。”
伊藤博文同意由內閣會議討論通過後交天皇裁定，天皇也無異議。於是，陸奧宗光約見大清駐日公使汪鳳藻，將共同改革朝鮮內政的照會交給他道：“請閣下致電貴國政府，盡速同意我國提案，以便彼此同心維護東亞和平。”
“朝鮮善後當然很重要，但在商議善後辦法前，中日兩國軍隊應當先從朝鮮撤出，然後從長計議。”汪鳳藻看了照會，心裏暗暗吃驚，日本顯然對朝鮮有野心。
陸奧宗光拒絕道：“觀察目前朝鮮的形勢，本國政府深信禍亂潛伏的根源很深，若不從根本上改革其弊政，就絕不可能求得永遠的安寧。目下若隻采取各種姑息的辦法，以彌縫一時，難免亂局卷土重來，作為鄰邦，日本實在一天也不能安心。如果朝鮮不改革內政，日本就不能撤退目前駐在朝鮮的軍隊。中國政府倘能體會我國政府的誠意所在，讚同此項提案，就是對日本安全的莫大幫助。希望貴公使務將此項提案通知貴國政府，並願知悉貴國政府對此提案的意見。”