雖然北京在工業遺產保護和再利用方麵取得了一些成績，但是在急速的城市化進程中，短期經濟效益與遺產保護之間的博弈從未停止過。開發建設中經濟效益至上，還是保護利用，以文化效益為主，二者之間的鬥爭從未停止過，許多有價值的工業遺產在這場戰爭中一批批轟然倒下，原本工業遺產就不甚豐富的北京城內，許多有價值的工業建築在漠然的目光中被摧毀，特別是21世紀以來房地產業迅猛發展，北京的老工業區因其較好的城市區位和低廉的拆遷成本被大量更新用作房地產開發，眾多有價值的工業遺產被拆除，令人心痛，令人瞠目。工業遺產保護迫在眉睫。北京工業遺產保護工作還有很長的路要走，需要我們正視現實，仔細認清工業遺產保護開發工作所處的困境及其麵臨的嚴峻挑戰，有針對性地開展進一步的保護開發工作。縱觀目前北京工業遺產保護工作中存在的問題，大致包含以下諸方麵。
1.工業遺產管理存在嚴重問題
首先，由於工業遺產種類多、分布廣、認定過程複雜，絕大多數工業遺產尚未被認定為文物保護單位，它們又大多位於城市黃金地帶，曾經是大中型國有企業，受規劃、建設、房管、城管、國資委、發改委等諸多政府部門管理，甚至有些遺產的產權也屬於這些部門，這就導致那些未被界定為文物、未受到重視的工業建築物和相關遺存不能享受文物級待遇。同時，由於部門間存在利益紛爭，工業遺產管理的責任和權力分配時常出現重疊或交錯，造成管理主體多元化，上級主管部門眾多，管理權分散混亂。複雜的管理體製造成工業遺產問題誰都管，誰都可以不管，其結果是誰都可以對遺產指手畫腳，但又都對遺產破壞不負責任。對工業遺產的保護開發缺乏統一的科學規劃和統籌管理，各部門依照自身工作需要對工業遺產問題提出的有關政策意見未必科學合理，有時甚至相互牴牾，阻礙了正常的保護開發工作。