東京大學明治文庫藏書以報紙和文書最為可貴。
報紙有《滬報》光緒三十四年（1908年）十月一日至十一月二十八日；《循環日報》同治十三年（1874年）五月至六月二十七日，光緒六年（1880年）一月四日至九月，光緒十年（1884年）二月至八月，光緒十一年（1885年）一月至八月，十一月至十二月；《順天時報》1913年7月18日至12月25日，1921年1月9日至1月14日，1922年1月30日至1926年12月31日；香港《華字日報》光緒二十二年（1896年）八月。《台灣日日新報》也藏該庫，但不及守屋圖書館齊全。
明治文庫所藏“文書”有：
第一，井手三郎關係文書。井手三郎於明治二十年（1887年）赴清，昭和六年（1931年）卒，有乙未日記、丙申日記等。我另有專條介紹，見本書卷二。
第二，宗方小太郎關係文書。宗方小太郎關係文書另一部分在國會圖書館，我另有專條介紹，見本書卷二。
第三，井上雅二關係文書。井上雅二關係文書中最重要的是日記部分，記述唐才常自立軍事，我另有專條介紹，見本書卷二。
第四，大三輪長兵衛關係文書。
第五，梅屋莊吉關係文書。見本書卷二。
第六，昭和時期日中關係史資料目錄。
第七，石井勖關係文書。
第八，山口重次關係文書。