章太炎和館森鴻“以文字訂交”，他們的“相善”，主要由於在治學方麵有共同點。館森鴻從岡鹿門、重野成齋治漢學，涉獵中國儒家經籍，推崇清代複興的古文經學，對顧炎武尤其服膺，“自謂當初啟其迷蒙者，實亭林也。”[13]館森鴻在《答鈴木清音書》中也說：“仆少好經術文章，頗自刻苦，而無所得，神誌荒惑。一日讀《顧亭林集》，慨然自起，雖奔走憂患，心耿耿未下，亭林其發我者歟？”[14]他以為顧炎武“器識最高”，“負經綸之才，求禮教於遺經，發憤著書，為後世慮者深矣”[15]。對顧炎武推崇備至。
館森鴻對清代古文經學“皖派”的開創者戴震也很欽仰，對友人譏笑他讀《戴東原遺書》加以駁斥，對一些人認為戴震之長隻在曆算、輿地、考據之學也以為不能“止於是”。認為“東原雖主考據，其以道自任，直與孟子不異”，戴震的著作“精心孤詣，實事求是，蓋千五百年無與比倫”[16]。不能“指其一二”，“妄加譏評”。館森鴻對王念孫、王引之父子的“訓詁精確”，也以為“千古無兩”[17]。
章太炎少時就佩服顧炎武的為人，並將自己改名為絳，號太炎，以示對顧炎武開創的清代古文經學服膺勿替。他對戴震也很推重。章太炎二十三歲起到杭州詁經精舍受業，詁經精舍的主持人正是從顧炎武、戴震、王念孫、王引之等一脈相承下來的清代著名樸學大師。因此，當他看到館森鴻的文稿中《與人書》論及戴震，即加長跋，曰：
推重東原，與鄙意最合。明季社會之佻達，西河、竹垞之武斷，望溪、海峰之迂闊，迭勝迭負，難為雌雄。自東原出，而三種氣息，皆漸次肅清，即專以考證言，實事求是。亦一變至道矣。況其發明性善，實與路索自由之說，東西並峙耶？東原雲：“宋儒以理殺人，死矣，無可救矣。”驟觀幾為吐舌，及細思之，所謂餓死事小，失節事大，及《離騷》不甚怨君等說，皆出自宋儒。大氐揭櫫三綱，使卑賤不得一豪自便者，實始於此。周、孔、孟、荀未有斯義也。以此為理，致人人失其自由，而禹域人心腐敗，遂至此極，所謂瘴氣性者非耶？東原主張性善，不免偏於尊孟，而欲彗掃瘴氣，則非此因不為功。噫！使東原之說早行，吾國亦當人人知自由矣。旻天不淑，斯編尚覆醬瓿，其亦如眢井之心史哉！[18]