一、小亞細亞希臘人暴動
公元前546年，波斯征服呂底亞。與呂底亞決戰前，居魯士曾經派使者要求希臘人倒戈，但除米利都見風使舵地與波斯結盟外，其他城邦無一例外地拒絕了。薩狄斯被攻陷後，希臘人如夢方醒，派人到居魯士處，希望訂立與呂底亞時相同條件的盟約：繳納一定數量的貢賦，內部自治。但居魯士用了一個漁夫捕魚的故事，巧妙地拒絕了希臘人的要求。希臘人見勢不妙，各自回國準備保衛自己的國家。他們雖然在泛伊奧尼亞聖地開會商量了對策，但並無統一方略。去斯巴達求援的使者，不過是讓斯巴達派出一個使者，給居魯士送去一個警告：不要觸動希臘人。然而居魯士聽說了希臘人的情況後，根本不為所動，而斯巴達人也無任何進一步的行動。好在居魯士需要應付更加緊迫的目標巴比倫和東方的西徐亞人，暫時沒有觸動希臘人。然而居魯士甫一離開，他留在薩狄斯的財務代理人帕克圖耶斯就煽動當地人暴動，而且在沿海希臘人地區招募雇傭兵。這讓居魯士意識到，必須對希臘人采取行動。在鎮壓了帕克圖耶斯的暴動後，居魯士命哈爾帕戈斯和呂底亞總督負責征討沿海地區的希臘人。盡管波斯人曾經遭遇某些挫折，但總體上進展順利，不僅大陸上的希臘城邦，連愛琴海島嶼上的一些希臘人城市，都被征服。波斯人的統治與之前的呂底亞人似乎並無根本性區別：繳納一定數量的貢賦，戰爭時期應波斯的要求出動軍隊，城市內部管理基本不受幹涉。因此岡比西斯末年波斯全國大暴動、波斯駐呂底亞總督也蠢蠢欲動時，小亞細亞的希臘人仍保持安靜。
然而，大流士登基後，為穩固波斯統治，采取了一係列強化帝國統一的措施。就其對小亞細亞希臘人城市的影響來說，一是貢賦可能增加，二是包括軍役在內的勞役類負擔加重。從居魯士到岡比西斯時代，各地的貢賦以所謂禮物的形式繳納。盡管所謂的禮物應當與國王期待的價值符合，但畢竟不是經常性的稅收。大流士改革後，伊奧尼亞被與卡利亞等組成一個納稅區，每年需繳稅400塔蘭特。另外，伊奧尼亞人需要參與波斯都城的勞作。波斯和希臘人的文獻中，都提到在蘇撒和波斯波利斯建築中的希臘人。此外，希臘人可能還需要在波斯軍隊中服役。加上大流士繼位後，可能為加強統治，獎賞自己的追隨者，對希臘人城市內政的幹預也顯著增加，尤其是把僭主統治強加到不少城邦頭上，與此時希臘人追求平等和民主的傾向背道而馳。諸種因素合並的結果，造成了公元前499年小亞細亞希臘人的暴動。