查證孫中山致港督卜力書及提出平治章程的時間，首先應當澄清此事與孫中山、李鴻章合謀兩廣獨立活動的關係。要言之，這兩件事雖然首尾相連，卻沒有直接關係。而平山周《中國秘密社會史》、陳少白《興中會革命史要》、馮自由《中華民國開國前革命史》和《革命逸史》，均將二者混為一談。陳少白、平山周係當事人，馮自由則長期追隨孫中山左右，還一度負責國民黨曆史資料的征集事務，他們的記述當然不能忽視。但是，上述三種資料均係事後回憶，大的格局不差，具體細節則不免疏漏舛錯，相互抵牾，特別是馮、陳二人的文字，不當不確之處甚多。如陳少白所述時間前後顛倒混淆，他將上書事放在李鴻章北上之前，與聯李謀兩廣獨立相聯係，又稱“際此中央無主”雲雲，似指8月15日八國聯軍入京，清室西逃之後。至於馮自由的記載，有時將上書時間置於6月上旬孫中山離開橫濱之前，有時又係於6月17日到達香港之際，莫衷一是。
將上書港督及提出平治章程與聯李獨立事相聯係，有一些難以逾越的障礙。其一，如前所述，上書言及7月28日清廷誅殺許、袁之事，而李鴻章7月18日已經北上，上書不可能預知未來。其二，盡管李鴻章北上後，孫中山並未完全放棄聯李意圖，但是，通觀上書全文及平治章程內容，絲毫未提及聯李之事，似不合情理。因為按照馮自由等人的陳述，上書及提出平治章程的目的，就在於聯李謀求兩廣獨立。其三，實現何啟、陳少白等人計劃的關鍵人物是港督卜力，據史扶鄰教授考證，1900年4月至6月，卜力休假離港，直到7月2日才返任到港。[6]因此，即使孫中山曾為與李鴻章合作一事上書港督，也絕非目前所見包括平治章程的這份文件。詹森教授在20世紀50年代撰寫的《日本人與孫中山》一書中已經明確指出，由何啟起草的文件即致港督卜力書和平治章程，隻是勾畫出一個未來的民族政府的輪廓，而未提到兩廣獨立。這一事實，便將該文件與向李鴻章提出的建議區分開來。史扶鄰教授也斷定，雖然不排除早些時候為了李鴻章的利益提出類似建議的可能性，平治章程應與李、孫交涉無關。