臨床醫學和心理治療是催眠術應用最多的領域，但除有助於緩解緊張、消除疲勞和減輕疼痛外，催眠術本身並無治療身體和心理疾病的功能，要發揮催眠的治療效能，必須通過積極心理暗示並將其與其他醫學和心理治療方法結合起來使用。
所謂催眠治療，就是在催眠狀態下，借助他人暗示和自我暗示，動員自身潛能，達到治療疾病的目的。催眠中顯意識受到抑製，潛意識高度興奮，無保留地接受了暗示信號，從而增強免疫功能，調節機體平衡，消除病理機製，取得治療效果。
人們憑借催眠暗示，可以控製血液循環，減慢或加快心跳，改變器官和腺體的機能，大大加快創傷或內傷的治愈速度，降低或升高體溫，還能誘發許多其他身體變化。
國外有研究報告指出：對於心理疾病，單獨使用精神分析療法，療效僅為75%；單獨使用認知行為療法，療效為85%；將上述兩種方法與催眠術結合起來，療效可分別提高到95%和99.5%。
催眠增進療效的一個重要原因是，可減少對心理治療的阻抗。
任何一種治療方法都不是萬能的，對精神分裂症、腦器質性損傷、冠心病和動脈硬化患者，實施催眠術可能會誘發疾病或使病情加重，在臨床應用中必須慎之又慎。