合作推理在課堂上的推廣麵臨的最大困難並不來自學生，而是來自教師。傳統授課法在很多課堂上依然是主流的教學方法。大部分支持傳統教學法的人認為教師主導的授課方式可以更有效地提高學生對課本內容的學習（Adams & Engelmann，1996；Chall，2000；Hattie，2009），他們認為教師可以搭建支架（scaffolding）促進學生知識和技能的學習，在講解課本內容時為學生提供更全麵、更有深度的解釋。教師也可以在授課中使用不同的講解模式，激發學生的積極性。有些教師認為教師對課堂的掌控能力決定了學生是否可以跟著教師循序漸進地學習。一旦教師失去對課堂的掌控力，課堂就會陷入混亂，同時，把主導權交給學生會導致教師無法預測學生在學習過程所犯的錯誤，教師也因此無法及時糾錯，這樣的顧慮在新教師中尤其常見（Tschannen-Moran & Hoy，2007；Weinstein，1998）。因此，若要在課堂上推廣合作教學法，就要先改變傳統的教學觀念。
首先，學生和教師應當意識到學習過程的掌控者是學生，並不是教師。在傳統的教師主導的授課方式中，教師是學習過程的掌控者，教師決定學生什麽時候可以講話以及用什麽樣的語言來回答教師提出的問題（Well & Arauz，2006）。盡管學生可以在課堂上提問，但是這些問題依然是遵循著教師的“腳本”，學生的思維仍然是建立在教師的思維方式上，學生並沒有足夠的自由來根據自己的理解或者需求提出真正讓自己費解的問題。此外，學生往往隻是在機械式地記憶教師傳授的知識或者重複常規性的解題步驟，並沒有重新組織信息架構新知識的機會。但是，在合作推理討論中，教師應當把自主權交給學生，充分信任學生的合作能力和自我管理能力，給學生自由表達意見的機會，鼓勵學生有不同的意見，對學生的論述方法或者思維過程給出評價。在合作推理討論中，學生往往圍成一圈，在彼此可以看到對方的情況下參與討論，教師可以和某一組學生坐在一起，也可以在不同的小組之間移動。教師是否作為成員參與討論取決於學生討論的情況，如果學生中沒有人發言，或者發言者集中在少數幾個學生身上，教師就應該適時介入，保證每個人都有公平的發言機會。但是教師絕對不是主導者，討論中學生也不需要舉手，整個討論的氛圍開放且自由，每個人既尊重別人的觀點，又敢於提出不同的意見。