“軟件”這個詞僅僅從20世紀50年代才開始被廣泛使用。當然，它的出現與第一台電子計算機的發明是聯係在一起的，尤其是這些計算機在50年代末期首次被應用至商業領域，這給專門從事軟件供應的公司帶來了發展機遇。①那時，軟件僅僅是一些簡單的編碼，它在輸入和輸出之間起著橋梁的作用。然而，尤其是過去的這20年間，軟件已經從機械編碼的小灌木叢發展成為覆蓋全球絕大部分地區的森林，它被轉譯成200多種不同的語言，並且囊括了電動牙刷到汽車等日常生活的所有設備。②
幾乎從它被植入開始，生物學和信息化已經在軟件身上交織於一起。從現代計算機誕生的那一刻起，新的機器就被以生物學的術語進行架構。比如，從20世紀40年代起，約翰·馮·諾依曼就對計算機邏輯和生物學之間的關聯產生了興趣。關於電子數據計算機的第一份經典報道就曾把電子回路比作神經細胞①,將設計的輸入和輸出部分比作器官②。從那時起，生物學的隱喻在軟件和計算機領域流行起來。從某方麵看，這種流行並不應該太令人驚訝，畢竟，許多早期控製論和係統論的理論隱喻部分地來自生物學領域的還原性概念。有人可能會認為，如賽奇維克(Sedgwick)所言，問題在於“現實的計算機式的肌肉”還不能用於實際操作③。生物學本身就是一場拖延了太久的戰爭，戰爭的一方認為生物學領域可以被還原為一係列計算公式，另一方認為有機體不能被還原為它的部分的總和。持第一種觀點的生物學家們認為，至少控製論模型是機械思維的一種自然延伸，它們在19世紀有清楚明白的前身(但是也許甚至可以追溯到笛卡爾對人和機器式的動物的區分),這一思路的最新體現就是“預測生物學”,它希望能夠在電腦中建立起人類細胞(組織、器官甚至是有機體)的行為模型。