魏晉南北朝時期，佛、道二教在弘法納徒的同時，也在不斷地完善其自身的思想體係。佛教在吸收儒、玄思想，尤其是玄學的唯心主義哲學思想基礎上，提出了佛性說、頓悟說等學說，構建起中國化的宗教哲學。道教在進行自身改革的過程中，吸收了佛教的諸多學說，形成了新的宗教哲學體係。從而為隋唐時期佛教與道教更大規模的發展奠定了基礎。
一、《阿含經》的傳譯與小乘佛教思想
《阿含經》是小乘佛教經典，它用較為樸素、簡潔的文字介紹了釋迦牟尼早年的說法內容和佛教的基本教義。東漢時最早傳譯的《四十二章經》便是《阿含經》要點的輯錄。此後，東漢末年的安世高，三國時的支謙，西晉的竺法護、法立等都曾譯出了不少《阿含經》的單品經。十六國東晉及南北朝初期，印度、西域僧人紛紛來內地傳教譯經，他們把《長阿含經》《中阿含經》《雜阿含經》《增一阿含經》這“四部阿含”傳了進來，在漢族學僧的協助之下，全部譯成了漢文。其中《長阿含經》於後秦弘始十四年至十五年（412—413年）在長安譯出，由罽賓沙門佛陀耶舍口誦，河西僧人竺佛念翻譯，道含筆錄，共12卷，包括30部經。《中阿含經》於東晉隆安元年至二年（397—398年）在建康譯出，由罽賓沙門僧伽羅叉口誦，僧伽提婆翻譯，豫州僧人道慈筆錄，共60卷、222部經。《增一阿含經》於東晉隆安元年（397年）在建康譯出，由罽賓沙僧伽提婆翻譯，道祖筆錄。《雜阿含經》為法顯西行求法帶回，南朝劉宋初年在建康譯出，由中印度僧人求那跋陀羅口宣梵本，寶雲翻譯，慧觀筆錄，共50卷、1362部經，其最小的經為十幾個字一部。據學者們考證，《阿含經》較為真實地反映了早期佛教的基本教義。
《金光明經》殘卷（東晉）新疆吐魯番出土