清前期，蒙古、藏、維吾爾、彝等少數民族的史學有所發展。
一、蒙古族史學
成書於清代康熙元年（1662年）的《蒙古源流》是這一時期蒙古族史學中的一部巨著。本書原名為《額爾德尼·托卜赤》，簡譯為《寶貝史綱》，是鄂爾多斯蒙古族學者薩囊徹辰以蒙古文寫成的。這部蒙古文史學著作由喀爾喀親王成袞紮布把家傳抄本進獻給乾隆帝後，奉敕譯成滿文，並由滿文譯成漢文，名《欽定蒙古源流》，收入《四庫全書》史部。這部蒙古編年史記載了元、明兩代蒙古各汗的事跡，尤以達延汗與俺答汗的記述更為詳盡。本書是研究蒙古曆史的重要著作，與《元朝秘史》、《蒙古黃金史》合稱為蒙古族三大曆史著作。
這一時期的史學著作中，還有克什克騰旗的拉西彭楚克的《大元盛朝史》、噶爾丹台吉的《寶貝念珠》以及成書於19世紀上半期的《水晶鑒》等。此外，還有一些精通漢文的蒙古族學者用漢文撰寫的著作，如博明的《西齋偶得》、《鳳城瑣錄》和鬆筠的《綏服紀略》等，對蒙古族的曆史與地理均有所考訂與論證。
這一時期，有關衛拉特蒙古的幾種托忒文史學著作是值得重視的，這些史學著作對研究衛拉特蒙古史和北方民族關係史有著重要參考價值。應該提到的是《咱雅班第達傳》，這是一本論述和碩特喇嘛僧咱雅班第達的傳記，但本書論述的內容並未局限於咱雅班第達個人的一生活動，而是以咱雅班第達一生活動為主線，揭示出當時衛拉特蒙古各部的社會狀況、政治變遷以及與喀爾喀蒙古和西藏的關係，為研究17世紀上半期的蒙古史和蒙藏關係史提供了可貴的資料。本書作者拉特納哈德勒是咱雅班第達的弟子，追隨其師學佛傳教，對其師一生活動十分知情，故其所記頗為真實可靠。本書大約完成於1690年前後。