從他的自然哲學、特別是他的人性論和認識論的觀點出發，盧梭對教育問題進行了非常深刻的闡述。他認為，教育的一個最重要的原則就是要順應自然，“如果你想永遠按照正確的方向前進，你就要始終遵循大自然的指引”。①從這一根本的原理出發，盧梭詳細闡述了他的自然教育的目的、階段、內容、方法等思想。
順應自然的思想落實到教育目的上，首先就要求教育培養自然人，這種人完全是為他自己而生活的。他不依從於任何固定的社會地位和社會職業，不受傳統束縛，能適應各種客觀發展變化的需要。它既有哲學家的頭腦，又有農夫或運動員的身手。但這種自然人並不是一個孤獨的人，而是社會中的一個成員，並能夠盡到社會成員的職責，所以，他同時又是社會公民。
根據他自己對人的身心發展特點的研究，盧梭把自然人的培養過程分成了嬰兒期、兒童期、少年期、青年期四個階段，並且規定了每個階段的教育重點分別是體育、感覺器官的訓練、智育和勞動教育、道德教育。他對兒童的體育和感官教育特別強調，認為這是兒童發展的基礎，它要求家長和教師不能任意地幹涉兒童的自由活動，不能把自己的意願強加給兒童。在智育方麵，他特別提出了消極教育的思想，認為在兒童理性尚未發展的時候，不要對他進行過多的智育。在教育內容上，他主張讓兒童學習實用的知識，強調兒童判斷力的培養。他說：“人的智慧是有限的，一個人不僅不能知道所有的一切事物，甚至連別人已知的那一點點事物他也不可能完全都知道……問題不在於他學到的是什麽樣的知識，而在於他學的知識要有用處。”①在教育的方法上，盧梭強調兒童學習興趣的激發，強調實物和直觀教學，主張讓兒童在生活中，通過自己的實際行動來獲取有用的知識，他主張兒童向自然學習，反對死讀書，反對空洞的說教。他說，“真正的教育不在於口訓，而在於實行”②,他還說：“他所知道的東西，不是由於你的告訴而是由於他自己的理解。不要教他這樣那樣的學問，而要由他自己去發現那些學問。”③此外，他還特別談到了青春期的愛情教育和女子教育問題，在教育史上，盧梭是為數不多的重視這些教育問題的教育家。