（一）性質不同
在票據時效製度下，一定期間內不行使票據權利，則實體權利消滅；在訴訟時效製度下，訴訟時效期間內不行使權利，則導致勝訴權消滅。
（二）所依據的法律不同
訴訟時效依據《民法通則》的規定，票據時效依據《票據法》的規定，因此是一種特別法上的消滅時效。
（三）適用對象不同
《民法通則》規定的訴訟時效有兩種，即特別時效與一般時效，前者僅適用於《民法通則》特別指明的債權債務，後者則適用於除適用前者之外的債權債務；票據時效僅針對票據上的權利義務，即僅適用於票據關係，不適用於其他權利義務關係，並對付款請求權和追索權存續的時效分別進行了規定。
（四）期間不同
《民法通則》中規定的訴訟時效，一般時效期間為兩年，在期間起算方麵通常使用“從知道或者應當知道權利被侵害之日起”。《票據法》所規定的票據時效，根據票據的不同種類，規定了兩年、六個月、三個月等不同的期間，並規定了不同期間的計算日，例如出票日、到期日等。