赫爾巴特的教育教學體係由管理、教學和訓育三部分構成，其思想集中體現在《普通教育學》一書中。在這本書裏，他闡述了自己對於教育目的、教育內容以及教學階段等諸多方麵的見解和主張，向我們描繪了一幅完整的學校教育圖景：教育的目的是對年青一代進行道德品質以及均衡的多方麵興趣的培養，學生對知識的接受是新舊觀念融合並引起多方麵興趣的過程。課堂教學可以具體劃分為四個階段：明了、聯想、係統、方法。“明了”就是使學生對所要接受的知識清楚明白；“聯想”是使學生的新觀念與舊觀念相融合；“係統”就是使這種融合成為體係；“方法”則是設法使學生獲得的係統知識應用於各種場合。
縱觀赫氏的教育學體係，既可以看做是一種“從目的到方法”的結構，同時也可以看做是一種完整的“教育過程”結構。這種理論體係具有一定的科學性，代表了當時教育學理論體係發展的最高成就。曾有學者認為，繼赫爾巴特之後的各種學派，無論其理論的嚴密性、係統性和完整性，還是在實際教育工作中的指導性和可應用性，都未能超過赫爾巴特教育學。不僅如此，赫爾巴特還積極參與教育教學實踐，他創辦教學論研究所，舉辦教育學研究班和附屬實驗學校，培訓教師，並開展多種多樣的教育教學改革探索與實踐。1835年，在長期的理論思考和實踐的基礎上，赫爾巴特發表了《教育學講授綱要》,使其教育理論體係更為完善。
《普通教育學》是赫爾巴特的代表作，同時也是其最著名、流傳最廣的教育學著作，書名全稱為《從教育目的引出的普通教育學》。這本書構思10年，修改10年，可謂赫爾巴特多年心血的結晶，他後來的教育著述也多是圍繞《普通教育學》這個體係而展開。該書由三編構成，之前加有一個“緒論”。在緒論裏，赫爾巴特著重說明教師學習教育學的意義與作用，還論述了教學與教育的關係以及教育目的與作用等問題。第一編“教育的一般目的”,包括兩章：“兒童的管理”“真正的教育(本身)”,主要論述了管理和教育的一般目的問題。第二編“多方麵的興趣”有六章：“多方麵性的概念”“興趣的概念”“多方麵興趣的對象”“教學”“教學的過程”“教學的效果”,主要論述了興趣的多方麵性問題，並以此為基本原理來解釋學校的教學計劃和學科設置，闡述了教學的過程、環節等一係列教學論問題。第三編“性格的道德力量”分六章：“究竟什麽叫做性格”“論道德的概念”“道德性格的表現形式”“性格形成的自然過程”“訓育”“訓育特殊性的考察”,主要論述了訓育和道德性格的形成問題。