上述梳理提出了一個更深層的問題：除了各種具體的哲學理論之外，有沒有一個超越於各種具體哲學之上的元哲學（metaphilosophy）？因為這個問題涉及哲學究竟如何反思科學。如果認為哲學都是具體的，並不存在超越於具體哲學之上的元哲學，那麽哲學對科學的反思就是某種具體的哲學理論對科學的反思，當然這種反思會因具體哲學框架的不同有所不同；但如果以為在具體哲學之上有一種元哲學，那麽就有一個反思科學的合法性或合理性問題，即究竟哪種哲學有資格或更合適於反思科學。這就需要我們處理元哲學與哲學之間的關係。
對於維特根斯坦而言，學界往往關注他為分析哲學提供的兩種範式（“圖式”論和“生活方式”說），其實維特根斯坦對於“元哲學”的討論才是最值得注意的地方，因為這些討論思考了何謂哲學？有沒有超越一切具體哲學之思的“第一哲學”等重大問題。
有人認為，所謂元哲學“就是以哲學自身作為對象的次一級的研究，或者稱為‘哲學的哲學’”，“元哲學的觀點就是一種超越。它是站在各派哲學之外，從一個客觀的、公正的和總體的觀點、立場來重新審視哲學”，“從元哲學的觀點看，哲學最根本的特征就是沒有一個適用於一切哲學的定義”[2]。
元哲學以哲學自身為研究對象是正確的，但說元哲學是“一種超越”則是錯誤的。元哲學並不是超乎哲學之上的哲學，也不是不同於作為其對象的哲學的哲學。元哲學本身就是一種哲學，而且是一種具體的哲學理論，想在哲學之外尋找元哲學或構造超乎哲學之上的元哲學，是不合實際的想法。元哲學並不在哲學之外，而在哲學之中，它就是哲學本身。元哲學對哲學的研究不是超越的哲學對具體的哲學的研究，而是一種哲學對另一種哲學或另一些哲學的研究。當哲學家在回答“哲學是什麽”的時候，他並不是在做超越哲學之上的工作，而正是他的哲學研究本身，他對“哲學是什麽”或元哲學問題的回答，並不是“客觀的、公正的和總體的”回答，而是以他的個人哲學對哲學自身的一孔之見。