李贄去世的第二年，即萬曆三十一年（1603），王圻所撰《續文獻通考》刊行於世。這部典製體曆史巨著的誕生，是晚明史學的又一個重大成就。
王圻，字元翰，上海人，嘉靖四十四年（1565）進士，曆官陝西布政參議。後罷絕仕途，“築室淞江之濱，種梅萬樹，目曰‘梅花源’。以著書為事，年逾耄耋，猶篝燈帳中，丙夜不輟。所撰《續文獻通考》諸書行世”[100]。王圻所撰諸書，見於《明史·藝文誌》著錄的有以下幾種：《續定周禮全經集注》14卷（經部禮類），《續文獻通考》254卷、《兩浙鹽誌》24卷（史部故事類），《東吳水利考》10卷（史部地理類），《三才圖說》106卷（子部類書類），《鴻洲類稿》10卷（集部別集類）；其未著錄著者，還有《稗史匯編》175卷。以上，除《鴻洲類稿》（亦作《洪洲類稿》）是他的詩文集外，都是曆史著作或與曆史有關的著作。清人評論王圻說：“圻所著述，如《續文獻通考》、《三才圖會》（按即《三才圖說》）、《稗史類編》諸書，皆篇帙浩繁，動至一二百卷。雖龐雜割裂，利鈍互陳，其采輯編排，用力亦雲勤篤。計其平日，殆無時不考古研今。”[101]在著述的繁富上，王圻是可以同王世貞並駕齊驅的。
《續文獻通考》是王圻的代表著作。這部包含254卷的典製史巨著，共分為30門：田賦、錢幣、戶口、職役、征榷、市糴、土貢、國用、選舉、學校、節義、職官、郊社、宗廟、王禮、諡法、樂、兵、刑、經籍、六書、帝係、封建、道統、氏族、象緯、物異、輿地、四裔、方外。書首載有王圻於萬曆十四年（1586）所書凡例16條，以及他所撰的《續文獻通考引》；還載有溫純序文（萬曆三十一年）、周家棟序文（萬曆三十年）、許維新書後（萬曆三十一年）。王圻在本書引言中簡略地說到了他撰寫此書的目的：“文與獻皆曆朝典章所寄，可缺一也與哉？貴與氏（按指馬端臨）之作《通考》，窮搜典籍，以言乎文則備矣，而上下數千年忠臣、孝子、節義之流及理學名儒類皆不載，則詳於文而獻則略。後之說禮者能無杞、宋之悲哉！”[102]質言之，在馬端臨《文獻通考》的基礎上，充實“獻”的部分，即“忠臣、孝子、節義之流及理學名儒”的言論，使“文”與“獻”都得以廣泛流傳，“俾往昔賢哲舉得因事以見姓名，而援古據今之士不至溟涬無稽”。在書的內容所包含的時限上以及門類的劃分上，他是“輯遼、金、元暨國朝典故以續其後，而又增節義、書院、氏族、六書、諡法、道統、方外諸考，以補其遺”。至於這書的撰述經過，作者並未論及。據溫純序說，王圻同他同舉進士，又同應召，乃“日相與聚談今昔典故”，知王圻有致力文獻之誌，“肆力搜羅，且四十年，遂成此考”。從萬曆三十年上推，“且四十年”恰當嘉靖之末，王圻“搜羅”資料的工作當開始於此時。他在萬曆十四年手書凡例16條，或許是他正式撰述的開始。前一階段大約二十一二年，後一階段大約十七八年。