從1992年開始到2002年，院校合並的**漸趨平息，我國共有31個省、自治區、直轄市，60多個國務院部門（單位）參與了高等教育管理體製的改革，涉及院校900餘所。在院校合並方麵，共有493所普通高校、215所成人高校經合並調整為305所新學校，其中，普通高校278所，淨減高校403所。歸納起來，合並主要有以下幾種類型。
（一）綜合指向型合並
這是指分布在同一城市或地區的不同高校為了組建綜合性的大學而進行的合並。這種合並主要分為以下兩種情況：一是由單科性大學合並而成的綜合性大學；二是由綜合性大學與單科性大學合並。前者以1992年合並而成的揚州大學、1993年合並而成的青島大學、1996年合並而成的石河子大學等為代表；後者以南昌大學、吉林大學、複旦大學、新疆大學等為代表。原吉林大學是一所綜合性大學，2000年，它與同處一市的吉林工業大學、白求恩醫科大學、長春科技大學、長春郵電學院合並成新吉林大學，成為我國大學的航母。複旦大學和新疆大學盡管層次不同，但也都是學科門類齊全的綜合性高等學校。2000年，複旦大學與上海醫科大學合並，新疆大學與新疆工學院合並。合並之後，兩校的學科門類更加齊全。
1.揚州大學的組建
揚州是我國的曆史文化名城，合並前的高校有揚州師範學院、江蘇農學院、揚州工學院、揚州醫學院、江蘇水利工程專科學校、江蘇商業專科學校。1988年，國家教委主任朱開軒到揚州視察，針對揚州高校布局的特點，他提議借鑒國外經驗，將這些高校組建成一所綜合性的大學。這一提議引起了江蘇省委、省政府的重視。1992年4月，江蘇省委、省政府正式給國家教委發函申請建立揚州大學，同年5月，國家教委批複同意建立揚州大學。這樣，原來分散獨立的高等學校便被合並成了一所涵蓋多個學科的綜合性大學——揚州大學。