有些采購部門不是采購過早就是采購過遲，或者疏忽了采購中的隱性成本，付款時采取了不利於自己的方式等。這些都會增加企業成本，造成待料停工損失、延遲發貨損失、喪失銷售機會損失和商譽損失等；如果損失客戶，還可能為企業造成間接或長期損失。
采購不當導致的間接成本可以分為以下幾種：
1.采購過早的成本
存貨不足意味著斷料、缺貨或失銷。因此，許多企業都會考慮保持一定數量的安全存貨而過早地采購。殊不知，過早采購會導致企業在物料管理費用上的增加，比如庫存費用、搬運費用等。而且，一旦訂單取消，過早采購的物料容易形成呆滯料。
2.采購過遲及其成本
采購過遲會相應地引起企業延期交貨。如果客戶願意等到下一個周期交貨，那麽企業實際上沒有什麽損失；但如果經常缺貨，客戶可能就會轉向其他企業。如果為了挽留客戶利用快速運送交貨的方式，則會發生特殊送貨費用。這項費用比普通運費要高很多。
若失去了客戶，也就失去了一係列收入，這種缺貨造成的損失很難估計。對於企業的直接損失就是這批貨物的利潤損失。除了利潤的損失，還應該包括當初負責這筆業務的人員人力、精力浪費等。除了利潤損失，還有由於缺貨造成的信譽損失。信譽損失對未來銷售及客戶經營活動卻非常重要。
3.全額付款的成本
在大宗物品的采購中，有些采購員為了不耽誤生產進度，往往采用全額付款的方式。結果，等到生產中發生問題，供應商往往一推了之，概不負責。
4.疏忽隱形成本的損失
某采購員被企業安排去想買一台複印機。他看好了兩款：A款的價格是1000元，而B款的價格為1400元。這兩款複印機的功能和質量相差無幾，所以他覺得買A款會更省錢。