高等教育學的學科理論研究包括知識體係構建和學科理論建設，前者以《高等教育學》教材為載體，後者多以論文為載體呈現學術觀點。聚焦這兩個方麵，我們對這一階段高等教育學的理論建設進行研究。
一、以《高等教育學》教材為基礎，對高等教育學體係的考察
我們以這一階段出版的高等教育學代表性教材為例，研究教材構建的知識體係及學科理論建設情況。
鄭啟明、薛天祥主編的《高等教育學》在章節和內容的邏輯結構安排上有自己的特色。該書分為五部分進行研究：第一部分為緒論；
第二部分包括第二章到第六章，研究高等教育的基本理論；第三部分包括第七章到第十三章，論述高等教育活動；第四部分包括第十四章到第十七章，論述辦好高等學校的條件；第五部分包括第十八章，論述高等學校的領導體製與行政管理。
該書的體係與潘懋元主編的《高等教育學》相比，沒有高等教育發展史和高等教育學研究方法的內容，新增加了第四部分辦學條件，在高等學校辦學和教育實踐活動上著墨較多。二者在分論部分的內容也不相同，體現出不同作者對高等教育的不同思考。鄭啟明、薛天祥主編的《高等教育學》作為高校管理幹部的培訓教材，對高校管理方麵自然有所側重。
任宇的《高等教育學選講》,主要是為高等學校理工科師生和研究生編寫的。該書重視實用性，從高等教育基本理論、高等學校教學、高等學校科研三部分進行論述。書中論述的院係結構、大學教學原則、教材建設等，都體現出作者從高等教育實踐出發，善於從實踐中總結，進而生成關於高等教育的理論，最後納入高等教育學的體係之中的特點。
中央教育行政學院編寫的《高等教育原理》,雖名為“原理”,但實際上該書呈現的是較為規範的高等教育學體係，也是高等教育學的一部代表性著作。該書論述了高等教育的基本理論，包括高等教育曆史、高等教育體製結構，又對大學生及體育、美育、德育進行了研究，隨後論述了教學、科研、教師、幹部等內容，體係完整，把握了高等教育的特點，適合作為教育管理幹部培訓教材。