貝克認知療法一般分為以下四個治療過程。
（一）建立求助的動機
在這一過程中，要認識適應不良的認知—情感—行為類型。病人和治療師對目標問題達成認知解釋上意見的統一；對不良表現給予解釋並估計矯正所能達到的預期結果。比如，可讓病人自我監測思維、情感和行為，治療師給予指導、說明和認知示範等。
（二）適應不良性認知的矯正
在這一過程中，要使病人發展新的認知和行為來替代適應不良的認知和行為。比如，治療醫師指導病人廣泛應用新的認知和行為。
（三）在處理日常生活問題的過程中培養觀念間的競爭，用新的認知對抗原有的認知
在這一過程中，要讓病人練習將新的認知模式用到社會情境之中，取代原有的認知模式。比如，可使病人先用想象的方式練習處理問題或模擬一定的情境，或在一定條件下讓病人以實際經曆進行訓練。
（四）改變有關自我的認知
在這一過程中，作為新認知和訓練的結果，要求病人重新評價自我效能以及自我在處理認識和情境中的作用。比如，在練習過程中，治療師通過指導性說明，強化病人自己處理問題的能力。